En su segunda fase, el proyecto pasó a la experimentación para estimar factores de emisión propios de la región. En Costa Rica se midió el metano entérico de 16 animales de raza Brahman en pastoreo con la técnica del hexafluoruro de azufre (SF₆), que permite que el ganado paste libremente mientras un collar recoge las muestras. Se comparó una pastura tradicional de ratana con una de pasto híbrido Cayman bajo pastoreo racional. El estudio mostró que la emisión diaria por kilo de peso vivo era mayor en los animales más livianos y disminuía a medida que crecían. Es un dato clave para mejorar los inventarios nacionales.
En paralelo, se establecieron cuatro sitios para medir el óxido nitroso con la técnica de cámara cerrada, validada por el proyecto para Centroamérica, y evaluar el efecto de distintos fertilizantes en pasturas activas. En Costa Rica y Nicaragua, la urea con inhibidor presentó los valores más bajos de emisión, mientras que en Honduras el bocashi emitió menos que la urea. En Honduras, el ensayo se hizo gracias a un convenio con el Centro Universitario Regional del Litoral Atlántico (CURLA) de la Universidad Nacional.










